بمكتبة آية الله العظمى المرعشي - قدس سره - بقم . وقد جاء توصيف النسخة في المجلد الثالث من فهرس النسخ المصورة في المكتبة . وهذه النسخة أصل لبعض النسخ الآتي ذكرها كما سأشير لذلك . وتختلف مع القسم الأول في السياق ، كما انها تنقص عنه شيئا ؛ إذ أنها تشرع بالمباحثة الرابعة - ولا يوجد فيها ما في صدر الرسالة من الرقم ( 127 ) إلى آخر ( 141 ) وجاء بدلا من هذا كله : « بسم الله الرحمن الرحيم . رب يسّر بلطفك العميم . الحمد لله واهب العقل ، مفيض العلم ، والصلاة على رسله ، خصوصا على محمد وآله . . . » . ثم جاء الرقم ( 142 ) « ما معنى العقل بالقوة . . . » إلى آخر الرقم ( 266 ) وذلك يطابق الورقة ( 16 ب - 23 آ ) منها . ومن هنا كتبت المباحثة الأولى « وصل للشيخ عدة كتب . . . » الرقم ( 1 ) إلى آخر الرقم ( 31 ) وذلك يطابق الورقة ( 23 آ - 25 ب ) . وهنا انتقل إلى الرقم ( 267 ) إلى اخر الرقم ( 309 ) وذلك يطابق الورقة ( 26 آ - 27 ب ) . ثم كتبت المباحثة الثانية ، الرقم ( 32 ) « وصل كتاب الشيخ الفاضل . . . » إلى آخر المباحثة ، الرقم ( 46 ) . ويطابق الورقة ( 27 ب - 29 آ ) . ثم يوجد الرقم ( 310 ) إلى آخر الرقم ( 396 ) ويطابق الورقة ( 29 آ - 33 ب ) منها . ثم تشرع المباحثة الثالثة ، الرقم ( 47 ) « وصل خطاب الشيخ الفاضل . . . » إلى آخر المباحثة ، الرقم ( 126 ) ويطابق الورقة ( 33 ب - 39 ب ) ثم تشرع المباحثة السادسة ولا يوجد فيها ما في صدر الرسالة وتشرع بالسؤال الرقم ( 400 ) إلى آخر الرقم ( 787 ) ويطابق الورقة ( 39 ب - 67 آ ) وبقية المباحثة السادسة غير موجودة فيها . وجاء في آخر الرسالة : « هذا آخر الموجود من هذا الكتاب تم كتاب المباحثات المعروف