دعاء حضرت در بستر خواب پيغمبر ( ص ) را دعاهاى مختلفى بود كه وقتى به بستر خواب مىرفت آنها را مىخواند . از آنهاست : « خداوندا من از عقوبت و مجازات تو به عفو تو پناه مىبرم و از خشم تو به خشنودى تو پناه مىجويم ، و از تو به تو پناهنده مىشوم . بار خدايا من توان آن ندارم كه حق سپاس و ثناى تو را ادا كنم ، هر چند كه در اين راه حرص و كوشش به كار برم ، تو چنانى كه خود ثناى خود كردى » . و بهنگام خواب مىفرمود : « بنام خدا ميميرم و زنده‌ام و بازگشت ما بسوى خداوند است ( سرنوشت ما بدست اوست ) . بار خدايا مرا از آنچه مىترسم در امان بدار و عورت و اسرار مرا پوشيده بدار و امانت مرا ادا كن » . آنچه بهنگام خواب مىفرمود : بهنگام خواب آية الكرسى مىخواند و مىفرمود : جبرئيل بر من درآمد و فرمود : اى محمد عفريتى از جن ترا در خواب رنج مىدهد بر تو باد به آية الكرسى .