مؤلفاته : ( 1 ) " وركبت السفينة " : صدر عن مركز الغدير سنة 1997 م - 1418 ه‍ . جاء في مقدمة الناشر : " إن كتاب ( وركبت السفينة ) للأستاذ خلفيات نموذج لوقفة التأمل مع الذات ، والنظر في الموروث ، والانطلاق ببحث علمي مقارن ، وتحقيق موضوعي رصين يكشف عن وعي الكاتب للتاريخ ، كما يسجل مساهمة في إعادة كتاب فصل من فصوله ووقائعه . وهي رحلة علمية ومذهبية رائعة تجلّت فيها حرية الفكر ، والبحث المحايد عبر السفينة التي أبحر فيها من شاطئه الذي كان يستقرّ في مآويه إلى الشاطيء الآخر آمناً من مخاطر الأمواج وقصف الريح الكواسح ، مستهدياً بالكتاب والسنّة وأدلّة العقل وشواهد التاريخ ، وهذا العمل الثقافي الرصين يشكّل مساهمة فعّالة في التقريب بين المسلمين واسقاط الحواجز النفسية ، وتعريف بعضهم بالبعض الآخر " . وجاء في تقديم الدكتور عبد الهادي " الكتاب . . . هو من تلكم الكتب التي كتبت انتصاراً لمذهب أهل البيت من مؤلف تخصص جاميعاً بدراسة المذاهب الإسلامية ، وحملته روح المقارنة والموازنة إلى تأليف كتابه هذا ليتوصل إلى معرفة الفرقة الناجية التي أشارت إليها رواية " ستفترق أمتي . . " كما ذكر هذا في مدخل كتابه . فتناول في بحثه نشوء المذاهب السنية في العقيدة والتشريع ، واضعاً إصبعه أبرز المعالم الفكرية فيها وأهم الاشكالات في أسس هذه المذاهب ، من واقع حياة الصحابة في اجتهادهم وعدالتهم وشؤونهم الأخرى ترتبط بموضوع البحث .