اين رفت و آمدها و برخورد آراء و نظريات مختلف ايجاب ميكرد كه يك شخصيت لايق و برجسته در رأس جامعه شيعه قرار گيرد ، از اين رو شيخ بزرگوار صدوق كه از هر جهت شايسته مقام رهبرى بود در اين شهر اقامت گزيد و از حدود و ثغور مذهب اهل بيت عليهم السّلام با قلم و بيان دفاع كرد ، و شبهات را پاسخ گفت . سرپرستى شيعيان خراسان ابن بابويه مدتى به عنوان رهبر و مقتداى شيعيان خراسان در نيشابور اقامت گزيد ، و از اين رو وى را « وجه الطائفه بخراسان » نوشته‌اند ، محدث بزرگوار در نيشابور كه مجمع فرق و مذاهب مختلف اسلامى و غير اسلامى بود سالها اقامت نمود ، و در ترويج مذهب شيعه بسيار تلاش كرد ، و فكر تاليف كتاب « كمال الدين » در اين شهر برايش پيدا شد و پس از مراجعت به رى آن را پايان داد . مسافرت‌هاى علمى صدوق شيخ صدوق مسافرت‌هاى دور و درازى در بلاد شرق و غرب اسلامى انجام داد ، و با محدثين بزرگ و رجال عاليقدر ملاقات كرد ، وى از شهرهاى : سرخس ، مرو رود ، بلخ ، بخارا ، سمرقند ، ايلاق و فرغانه در خراسان و از بغداد ، مكه ، مدينه و قيد ديدن كرد و با رجال حديث آشنا شد و در تاليفات خود از اين بلاد نام برده است . ابن بابويه يك بار به بيت اللَّه مشرف شده و دو مرتبه هم به زيارت حضرت