نسخه‌هاى خطى كتاب عين‌اليقين اين چنين مىآوريم : نسخ ، ابن شاه مرتضى ، 1070 ، ش 2946 ، دانشگاه تهران 829 / 10 / / ، مقابلهء علم‌الهدى در 1085 ، ش 804 ، آستا 209 / 4 / / ، عصر مؤلف ، ش ( 8 ) 933 ، مجلس 234 / 23 ( ناقص‌الاخر ) / / . . . / / ، سيد عبداللّه جزائرى ، 1141 ، ش 1978 ، گلپايگانى 125 / 3 ( در مقدمه اين نسخه رساله‌اى درباره فيض آمده است ) / / . . . / / نستعليق ، سدهء 12 ، ش 16593 ، آستا [ رؤيت ] ( ناقص‌الطرفين ) / / . . . نخستين نسخه ما ، نسخه‌اى است به خط نسخِ ابن شاه مرتضى كه در سال 1070 قمرى كتابت شده و به شماره 2946 در فهرست كتابخانه مركزى دانشگاه تهران ، جلد دهم صفحه 829 معرفى شده است . نسخه دوم ، مقابله علم‌الهدى فيض كاشانى در سال 1085 ( كاتب نامعلوم ) كه به شماره 804 در فهرست كتابخانه آستان قدس رضوى جلد چهارم صفحه دويست و نه نمايانده شده است . ديگر نسخه ، در عصر مؤلف كتابت شده و اكنون ناقص‌الاخر است و در مجموعه شماره ( 8 ) 933 مجلس است و در جلد بيست و سوم صفحه دويست و سى و چهار آمده است . خ ) معرفى نسخه‌هاى چاپى ( ن . چ ) اگر رساله يا كتاب مورد نظر به زيور طبع آراسته شده است در اين بخش اطلاعات كتاب‌شناسى آن ، چون اهتمام كننده ، محل نشر ، ناشر ، تاريخ چاپ ، تعداد صفحات و نوع چاپ مندرج مىشود . د ) ذكر ترجمه شرح ، حاشيه ، تعليقه ، ردّيه و . . . پس از ذكر موارد چاپى اثر ، اگر كتاب يا رساله مورد نظر ، دست‌مايه كار پژوهشگران بعدى قرار گرفته باشد بدين معنا كه ترجمه يا شرحى و يا تعليقه‌اى و . . . بر آن ارائه كرده باشند . اين موارد تجزيه و تحليل و بررسى شده و تمامى اطلاعات آنها بيان مىشود . براى مثال نگاه كنيد به شروح متعدد كتاب مفاتيح‌الشرايع .