آثار والد مكرمش ملا عبد الله مدرس زنوزى يعنى حواشى الزنوزى على حواشى الفياض على شرح القوشچى على التجريد و لمعات الهيه مهمترين اثر ملا عبد الله است . تعليقات لمعات الهيه تنها اثر فارسى جلد دوّم مجموعه است . بالاخره دو تعليقهء مختصر تعليقة واحدة على الحواشى الجمالية على الحواشى الخفرية على شرح القوشچى ، و تعليقة على حاشية رسالة سرّ القدر ابن سينا پايان بخش جلد دوّم اين مجموعه است . در دنبال ، به تفصيل به معرفى چهارده اثر ديگر آقا على در جلد سوّم مجموعه خواهيم پرداخت . بدايع الحكم مهمترين اثر حكيم مؤسس و يكى از پنج كتاب درجه اوّل فلسفه به زبان فارسى و يكى از ده كتاب درجهء اوّل فلسفهء اسلامى به قول مطلق ، جلد چهارم مجموعه مصنفات حكيم مؤسس به حساب مىآيد . پيشينهء لقب فاخر حكيم مؤسّس برخى از فلاسفه بواسطهء درخشندگى و خدمات علميشان از جانب ديگر حكما به القابى كه گوياى جايگاه رفيع عقليشان است مفتخر شده‌اند ، از آن جمله است : فيلسوف العرب ( كندى ) ، معلم ثانى ( فارابى ) ، شيخ الرئيس ( ابن سينا ) ، شيخ اشراق ( سهروردى ) ، امام المشككين ( فخر الدين رازى ) ، عقل حادى عشر ( خواجه نصير الدين طوسى ) ، معلم ثالث ( ميرداماد ) ، سيّد المدّققين ( صدر الدين دشتكى شيرازى ) ، صدر المتألهين ( محمد بن ابراهيم قوامى شيرازى ) . آقا على مدرس طهرانى نيز بواسطه ابتكارات متعدد فلسفى ، در زمان حياتش ملقب به عنوان برازندهء « حكيم مؤسس » شد . تصرف وى در مبانى و ارائهء تقريرهاى تازه از اصول صدرايى ، نقد حكيمانهء آراء فيلسوف پر آوازهء شيراز ، و ارائه نظرياتى جديد در نزديك بيست مسئلهء فلسفى از اسباب اين لقب است . ديدگاههاى بديع وى در مباحث معاد جسمانى ، اعتبارات ماهيت ، حمل ، وجود رابط ، علم و تقريرهاى تازه‌اى از مسائل اصالت وجود ، وحدت وجود ، بساطت وجود ، حركت جوهرى ، رابطه عرض و موضوع ، قوس صعود و نزول و . . . شاهدى براين مدعاست . علاوه بر مداركى كه بر رواج عنوان « حكيم مؤسس » در زمان حيات آقا على در صدر جلد اول مجموعه ارائه كرديم ، در اين مجال به مدارك ديگرى در اين زمينه اشاره مىكنيم :