علامه طباطبايى ، در اواخر عمر به بيمارى قلبى و عصبى دچار شد - حال ايشان روز به روز وخيم‌تر مىشد ايشان را در يكى از بيمارستان‌هاى قم بسترى كردند . عشق بسيار علامه طباطبايى به قرآن مجيد و خدمات ارزشمند وى به اين هديه الهى ، سبب نورانيت و صفاى روح اين مرد بزرگ بود . رئيس بيمارستانى كه علامه در روزهاى آخر عمرش در آن بسترى بود در پاسخ به يكى از شاگردان علامه كه از احوال ايشان پرسيده بود چنين گفت گرچه حافظه خود را در امور دنيايى از دست داده اند و به مسائل مادى بى توجهند ، پيوندشان با خدا و عالم معنويت استحكام يافته است . يكى از شاگردان علامه طباطبايى نقل كرده است : « در روزهاى آخر از علامه پرسيدم : در چه مقامى هستيد ؟ در حالى كه به سختى سخن مى گفت ، فرمود : مقام تكلم . پرسيدم : تكلم با كى ! فرمود » با حق . سرانجام پس از 81 سال و هيجده روز عمر با بركت و زندگى پر تلاش ، روح پاك و الهى آن حكيم عارف و مفسر وارسته ، درهيجده محرم 1402 ه . ق همزمان با 24 آبان 1360 شمسى به ديار قدسى و ملكوتى پر كشيد و دل هاى پاك انديشمندان و بزرگان عرصه دانش را غرق اندوه و ماتم كرد . والسلام نتيجه گيرى با توجه به سيره عملى علماى اسلام و نقش برجسته آن بزرگواران در تربيت شاگردان اين مكتب ، علامه طلباطبايى ( ره ) از جايگاه خاصى برخوردار است ايشان با تلفيق علوم مختلف كه در دوران خود از جايگاهى برخوردار نبود مانند فلسفه توانست آن را با عرفان و تفسيرمنطبق نمايد و باعث رشد علمى در بين عالمان حوزه گردد . علامه با ورود در علوم مختلف شبهاتى كه عليه اسلام و مكتب شيعه وجود داشت به مبارزه پرداخت بخصوص مبارزه با مكاتبى مانند ليبراليسم و مادى گرايى و اثرات ماندگارى از خود بجاى گذاشت كه مى توان آنها را از منابع اصيل به شمار آورد كه شاگردان زيادى را تربيت نمود از برجسته ترين آنها مىتوان به شهيد مطهرى ، علامه مصباح يزدى ، جوادى آملى اشاره كرد .