اعتراض مردم عليه رژيم گرديد . در روز دوم فروردين ماه 1342 - مصادف با 25 شوال 1382 سالروز شهادت امام صادق عليه السّلام - مجلس سوگوارىاى از سوى آيت الله گلپايگانى قدّس سرّه در مدرسه‌ى فيضيه برگزار گرديد . آن روز مأموران امنيتى وارد مدرسه‌ى فيضيه شده و به ضرب‌وشتم طلاب و مردم شركت‌كننده در مجلس پرداختند ؛ طلبه‌ها نيز به دفاع از خود برخاستند ، ولى كماندوهاى رژيم آن‌ها را به گلوله بستند ، به طورىكه آيت الله گلپايگانى قدّس سرّه هم مورد هجوم كماندوها و رژيم قرار گرفتند و فداكارى عده‌اى از طلاب جوان باعث نجات جان ايشان شد . اين قيام‌ها سبب پيدايش نسلى از روحانيون انقلابى شد كه در سال‌هاى پس از تبعيد امام خمينى قدّس سرّه ، هدايتگر نهضت وى به شمار مىآمدند ؛ اين عده كه آيت الله گلپايگانى قدّس سرّه از استوانه‌هاى اصلى آن‌ها بود با بهره‌گيرى از شبكه‌ى گسترده‌ى مساجد ، تكيه‌ها ، مراسم و شعاير دينى ، توانست گروه‌هاى متعددى از طرافداران امام خمينى قدّس سرّه را سازماندهى كند و گردونه‌ى انقلاب را به حركت درآورد . در سال‌هاى تبعيد امام خمينى قدّس سرّه ، آيت الله گلپايگانى قدّس سرّه در تداوم نهضت اسلامى ملت ايران نقش بسزايى داشتند . البته سابقه‌ى مبارزاتى ايشان به دوران مرجعيت محدود نمىباشد ، چنان‌كه نقل شده ، ايشان از ابتداى تحصيل در شهر اراك با محروم آيت الله حاج آقا نور الدين عراقى كه شخصى مبارز بود ، ارتباط داشته ، اغلب به خانه‌ى ايشان رفت‌وآمد مىكردند . معظم له بر سر عدم پيروى از دستور رضا شاه مبنى بر كشف حجاب ، شخصا با مأموران رژيم پهلوى درگير مىشوند ؛ ايشان دراين‌باره چنين مىگويند : « هنگام كشف حجاب كه به دستور پهلوى انجام شد ، شبى با خانواده براى شركت در مجلس روضه‌ى امام حسين عليه السّلام به منزل آقاى شيخ محمد حسين بروجردى مىرفتم ، ناگهان پليسى پيش آمد و اعتراض كرد كه ايشان ( خانواده ) با حجاب بيرون آمده ؟ من ناراحت شدم و دست بردم كه تفنگش را بگيرم ، او مىكشيد ، من هم مىكشيدم ؛ عاقبت او گفت : اين خطرناك است ، تفنگ پر است و ممكن است گلوله‌اى شليك شود ؛ من گفتم باشد شليك شود تا