شارك مع مجموعة من الشباب الحسيني في انتفاضة صفر 1397 ه / 1977 م المتوجهة إلى كربلاء مشياً على الأقدام ، رغم الإجراءات الأمنية المشدّدة ، والتي حاصرتهم بالطائرات والدبابات والمدرعات والآليات العسكرية لمنعهم من المسير إلى كربلاء لزيارة الأربعين . وقد كان الشهيد السيّد مصطفى الهاشمي متأثّراً جدّاً بأفكار ونظريات السيّد الشهيد محمّد باقر الصدر قدس سره ومن المواظبين على زيارته وحضور مجالسه لا سيما في ليالي الخميس والجمعة ، يغتنم أدنى فرصة لزيارته والتحدّث معه عن قرب ، والإمام الشهيد الصدر بدوره كان يتوسّم فيه خيراً ويحبّه كثيراً ويأنس به . كما كان الشهيد السيّد مصطفى من المعجبين بشخصية الإمام الخميني ، وبعد نجاح الثورة الإسلامية بقيادة الإمام الخميني ازداد حبّاً وتعلّقاً واندفاعاً نحو تأييد الثورة بكل الوسائل المتاحة لديه ، من خلال توزيع النشرات وصور الإمام ، وأشرطة صوتية من خطب وبيانات الإمام الخميني . وبمناسبة إعلان البيعة والولاء للإمام الشهيد الصدر كان الشهيد السيد مصطفى من ضمن وفود البيعة ، وعندما خرج من بيت الشهيد الصدر اعتقلته أجهزة الأمن في النجف ونقلته إلى مديرية الأمن العامة في بغداد ، فلاقى أشد أنواع التعذيب من جلاوزة الأمن ، لكنه ظلّ صامداً صلباً كالطود الشامخ لا تنال