هو العمل الجذري للمحقّق في تخريج مصادر الكتاب وتوثيق أقواله وأفكاره : المنطقيّة ، الفقهيّة ، الاصوليّة ، التاريخيّة ، الجغرافيّة والأدبيّة . . وقد كان تارةً يوثّق مصدر الفكرة إذا كان الشهيد الصدر قدس سره قد نسبها إلى شخصٍ معيّن ، وأخرى يُرشد إلى مصادر تعرّضت للفكرة وإن لم تكن منظورة إلى الإمام الشهيد قدس سره . وقد عمل في هذا الصدد على التثبّت من الإحالات الموجودة في المقالات المنشورة ، فصحّح بعضها ، وعدّل بعضها الآخر ، ثمّ عمل على إثرائها من خلال تدارك الموارد الكثيرة التي لم يتمّ توثيقها . تجدر الإشارة هنا إلى أنّ التحقيق قد اعتمد بادئ الأمر على توثيق الروايات اعتماداً على مصادرها الامّ ، ولكن تمّ العدول عن ذلك واعتماد كتاب ( الوسائل ) مرجعاً ، وذلك نسجاً على المنوال الذي نهجته لجنة التحقيق في سائر كتب موسوعة الإمام الشهيد الصدر قدس سره ، لكن مع الحرص على إبراز الاختلافات الموجودة بين كتاب ( الوسائل ) وبين الكتب الأربعة المطبوعة وغيرها من المصادر التي ينقل عنها صاحب ( الوسائل ) . خامساً : إضافة التعليقات : اشتمل الكتاب على جملةٍ من التعليقات في هامش المتن ، وقد توزّعت على النحو التالي : 1 - تعليقات الإمام الشهيد الصدر قدس سره على بعض هذه التقريرات ، وقد تمّ استخراجها من المخطوطات الواصلة إلينا والمحفوظة في الأرشيف ، والتي اشتملت على بعض التعليقات التي كان الشهيد الصدر قدس سره يزيّن بها ما يكتبه طلّابه تقريراً لبحثه ، وذلك في إطار رعايته الدراسيّة والعلميّة لهم ، وقد تمّ تذييلها بعبارة : ( من تعليقة الإمام الشهيد الصدر قدس سره على تقرير فلان ) .