منهج التحقيق قوبل كتاب مفتاح الفلاح على عدّة نسخ خطيّة ممتازة مصحّحة وهي : 1 - ثمان نسخ خطيّة بعضها مصحّحة ، وعليها علامة المقابلة والمراجعة ، وهذه النسخ لخزانة مكتبة آية اللّه العظمى المرعشيّ النجفيّ - قدّس سرّه - ، برقم : ( 42 ) و ( 501 ) و ( 697 ) و ( 1445 ) و ( 2496 ) و ( 4944 ) و ( 4980 ) و ( 6323 ) . 2 - نسخة ثمينة خطيّة لخزانة مكتبتنا ، استنسخت عن خطّ المؤلّف ، وهي نسخة مصحّحة كاملة ، مزدانة بحواشي العلّامة الخواجوئي - قدّس سرّه - ، وكان الأساس في تحقيق المفتاح على متن هذا الكتاب وفي موارد أشكلت عليّ راجعة إلى النسخ الخطيّة المشار إليه للمكتبة المذكورة . 3 - النسخة المطبوعة من الكتاب ، من منشورات دار الكتاب الإسلامي . وأمّا التعليقة للعلّامة الخواجوئي فقوبلت على نسختين : 1 - نسخة كاملة مصحّحة منقّحة لخزانة مكتبتنا ، وهذه النسخة غير مدوّنة كتبت بخطّ جيّد ناعم على هوامش كتاب مفتاح الفلاح ، وترجع تاريخ كتابتها إلى عصر المؤلّف ، وكانت هذه النسخة هي الأساس في استنساخ التعليقة وتحقيقها . 2 - نسخة كاملة مصحّحة ثمينة ، لخزانة مكتبة آية اللّه العظمى المرعشي النجفي - قدّس سرّه - برقم ( 3431 ) وكاتب هذه النسخة العلّامة الرجاليّ أبو الهدى ابن أبي المعالي بن محمّد إبراهيم الكرباسي ، تاريخ كتابتها سنة ( 1334 )