وتصانيف مؤيد الدين الطغرائي كثيرة في هذا العلم ومعتبرة عند أربابها منها : 1 - كتاب مفاتيح الرحمة ومصابيح الحكمة . 2 - وكتاب جامع الأسرار . 3 - وكتاب تراكيب الأنوار . 4 - ورسالة وسمها : بذات الفوائد . 5 - وكتاب حقائق الإستشهادات ، يبين فيه إثبات صناعة الكيمياء ، والرد على أبي علي بن سينا في إبطالها بمقدمات من كتاب ( الشفا ) . والكتب والرسائل في هذا الباب كثيرة ، لكن لا خير في الاستقصاء فيها ، وإنما التعرض بهذا القدر أن لا يخلو كتابنا عنها بالمرة . نسأل اللّه تعالى خيري الدنيا والآخرة .