آخوند فشاركى در مسجد نو بازار تدريس خارج مىكرد . تقريرات او را محصّلين آن زمان مىپسنديدند . شاگردان با استعداد خود را زود اجازه مىداد و متعذّر مىشد به اين‌كه به سبب داشتن اين اجازه مجبور مىشوند به كار كردن و ترقّى نمودن و حقيقتاً داراى ملكه اجتهاد شدن . برحسب اظهار خود ايشان بالاى منبر ، عده آن‌ها بالغ بر چهارصد نفر بوده . بيشتر علماى كرمان و يزد نزد او تحصيل كردند . مباحثه طلّاب در مجلس درس او همهمه‌اى داشت كه بسا روزها مجال تقرير به‌خود او داده نمىشد . تقريرات ساده او روى منبر خاص و عام را به خود جذب مىكرد . جمعيّت نماز و منبر او اهميّت داشت . غالباً دو سه نفر تندنويس ، منبرهاى او را ضبط مىكردند . شب‌هاى متبركه را نوعاً در تخته پولاد احياء مىداشت و اين احياى شب‌هاى جمعه به سبب او در شهر و تخته پولاد رونقى يافت . شب‌ها را بيشتر جهت عبادت به صحراها و خارج شهر مىرفت تا بالاخره دچار ضعف قلب گرديد . آخوند فشاركى در امور حكّام اصفهان موافقت نمىكرد ، با اين‌كه باعث رنجش آن‌ها مىشد ، مگر در واقعه تحريم تنباكو كه موافقت فتواى او با سياست باعث توهين او شد ، حتّى آن كه جمعيّت عوام ، شب در خانه او همه قِسم توهين و هتك حرمت از او كردند . وقتى كه از ناحيه ميرزاى شيرازى منع استعمال تنباكو در ايران و اصفهان منتشر شد و علما هم متابعت نمودند ، فتواى آخوند فشاركى مخالف مشهور واقع شد . به اين مناسبت وجهه عمومى از او تمايل حاصل نمود . « 1 » اين عالم جليل سرانجام در ماه رجب 1314 ق وفات كرد و در بقعه تكيه علامه آقا حسين خوانسارى در تخت فولاد مدفون شد . « 2 »

--> ( 1 ) . رجال و مشاهير اصفهان ص 416 - 415 . ( 2 ) . سنگ نوشته مزارش چنين است : « قد ارتحل إلي رحمة الله الملك العزيز الغافر العالم العامل المتتبّع الكامل الماهر ، صاحب المناقب والمآثر ، أبوالمكارم والمفاخر ، مروّج الأحكام من النواهي والأوامر ، مبيّن الحلال والحرام في المجالس والمنابر ، حجة الإسلام وآية الله علي الأنام في هذه الأيّام ، العلم العلام ، الفقيه القمقام ، والأستاد الفهّام ، مولانا الهمام الآخوند ملا محمّد باقر فشاركي الأصل ، الاصفهاني المسكن ، أعلي الله مقامه ، ونوّر مرقده ، وأسكنه بحبوحة جنانه ، في ليلة الأحد من الثاني والعشرين من شهر رجب من العام الرابع من العشر الثاني من المائة الثالث من الألف الثاني . و لله درّ من قال في تاريخ وفوده علي ربّه نظماً ، وهو هذا : قد فاز بالوفود علي ساحة الكريم * من كان في الأماثل كالبدر في النجوم إن شئت عام رحلته نحو ربّه * قل : « حبّذا بوفدك يا باقر العلوم »