هجرت به ايران نامبرده پس از اتمام وظيفهء سربازى ، چند روزى را در زادگاهش مىماند . ايشان براى رسيدن به مدارج بالاى علمى در ماه ميزان ( مهر ) همان سال ، به قصد عزيمت به مشهد مقدس به ولايت هرات مىآيد . پس از مدتى از مسير مرز ميلك وارد ايران مىشود ، ورود ايشان به ايران هم زمان است با اوج انقلاب اسلامى ايران ؛ اوائل آبان ماه همان سال وارد شهر مقدس قم شده و مدتى در مدرسهء مدينة العلم آية اللّه خوئى ( ره ) مشغول به كار مىشود . پس از چندى ، انقلاب اسلامى پيروز شده و امام خمينى ( ره ) وارد ايران مىشود . پيوستن به صفوف مجاهدين پس از مدتىكه خيزش‌هاى اسلامى عليه تجاوز روس‌ها در افغانستان آغاز مىگردد و احزاب جهادى شكل مىگيرد ، نامبرده با تعدادى از جوانان هموطنش براى آموزش دورهء چريكى به يكى از پادگان‌هاى قم آمده و مشغول آموزش شده و پس از چندى براى تكميل دوره ، عازم شيراز مىشوند . در پائيز سال 1358 ش ، جهت عمليات چريكى عليه روسها به دفتر جهادى حركت اسلامى واقع در زابل منتقل مىشوند ، شبها از داخل خاك ايران وارد حوزهء افغانستان شده ، پس از عمليات دوباره به مقرّ خود باز ميگردند . مدت‌ها جنگ‌هاى غير منظم ادامه داشته . اواخر سال 1359 ش ، به عنوان چريك و نمايندهء عام و تام حركت اسلامى با تعدادى از جوانان چريك وارد افغانستان شده و چندين ماه در كابل ، مزار ، جوزجان ، سرپل و بلخاب مشغول عمليات عليه خلقيها و روس‌ها مىشوند . در قريهء گذر سنگچارك مقرّ سيد محمد حسين قوماندان به آموزش جمعى از جوانان منطقه از جمله سرپل مشغول مىشود . سيدحسن احمدى نژاد در اواخر سال 1360 ش ، دوباره به ايران باز مىگردد . پس از چندى از مسير اسلام قلعه وارد افغانستان شده ، در بلخاب و سرپل مشغول تدارك