كان للسيد بعليكره مكتبة جيدة فيها كثير من المخطوطات الثمينة بالإضافة إلى مطبوعاتها ، أحرقت في ثورة طائفية عارمة في العشرين من صفر سنة 1394 وذهب على أثرها جملة من مؤلفاته بالإضافة إلى ما ذهب من أعلاق الكتب النادرة والمخطوطات النفيسة . هذه أسماء ما عرفنا من كتبه : * الاتحاد . * إثبات پرده . * الإجازات . مجموعة . * إسلام أور انسانيت . * إسلام كي حكيمانه زندگي . * أصول الدين أور قرآن . طبع بالهند سنة 1351 . * إعجاز القرآن . * أعلاق الذهب فيما ذهب عن أوراق الذهب . * إقالة العاثر في إقامة الشعائر . طبع بالنجف سنة 1348 . * أقرب المجازات إلى طرق الإجازات . إجازة كبيرة كتبها للسيد محمدصادق بحرالعلوم ، بيضها في سنة 1355 . * الإمام الثاني عشر . طبع . * انتقاض التيمم بدل الغسل بالحدث الأصغر . * البيت المعمور في عمارة القبور . طبع بالهند في سنة 1345 . * تاريخ الاسلام . أربعة أجزاء . * تاريخ مشاهير علماء الهند . أتمه بالنجف سنة 1347 . طبع في قم سنة 1432 باسم « تراجم مشاهير علماء الهند » بتحقيق السيد محمود الغريفي . * تاريخ وفيات الشيعة . نشر مقالات منه في مجلة « الهدى » العمارية . * تجارت أور اسلام . * تحريف قرآن كي حقيقت . طبع بالهند . * تخميس القصيدة العينية للحميري . خمّسها في الباخرة سنة 1350 . * تذكرة الحفاظ من الشيعة . طبع بالهند سنة 1353 في مجلدين .