منتدى النشر ، وكلية الفقه عام 1388 ه / 1968 م ، فاتجه للدراسة التخصصية العالية في الفقه والأصول ، فتتلمذ على أعلام أسرة آل الحكيم وهم « 1 » : 1 - السيد محمد علي الحكيم . 2 - السيد محمد سعيد الحكيم . 3 - السيد محمد حسين الحكيم . وكانت للعلامة السيد محمد جعفر الحكيم اهتمامات بدراسة السيرة النبوية الشريفة وحياة الأئمة عليهم السّلام ، وقد اشترك في ندوة علمية أدبية أسبوعية في النجف الأشرف وقدم خلالها بحوثا في الفقه والتاريخ والأدب وقد استمر في نشاطه العلمي حتى وقوع نكبة آل الحكيم بتاريخ 10 / 5 / 1983 م فاعتقل مع عدد كبير من أفراد الأسرة حتى الإفراج عنهم بتاريخ 7 / 6 / 1991 م ، فأخذ في استئناف نشاطه العلمي والتدريس في الحوزة العلمية ، فتتلمذ عنده جمع من طلبة العلم من آل الحكيم ، فضلا عن اللبنانيين والإحسائيين ، وكتب بحوثا ونشرها في مجلة كلية الفقه ، ومجلة البلاغ ، ومجلة البينة ، وأصدر كتبا في الفقه والعقائد : 1 - تقرير لدرس أستاذه السيد محمد سعيد الحكيم في الأصول بعدة أجزاء . 2 - تاريخ وتطور الفقه والأصول في حوزة النجف الأشرف . 3 - حاشية مختصرة على كتاب ( المكاسب ) للشيخ الأنصاري . 4 - حاشية مختصرة على الجزء الأول من كتاب تكملة المنهاج للإمام السيد الخوئي . 5 - دورة أصولية مستقلة .

--> ( 1 ) زودني بهذه المعلومات السيد محمد جعفر الحكيم .