كتب الإمام السيد الخميني في الفقه والأصول والحديث والتفسير وغيرها كتبا ورسائل هي « 1 » : 1 - أنوار الهداية في التعليق على الكفاية في جزءين . 2 - الأربعون حديثا ( شرح الأربعين حديثا ) . 3 - أسرار الصلاة أو معراج السالكين . 4 - آداب الصلاة . 5 - بيان القائد الإسلامي الكبير . 6 - بدائع الدرر في قاعدة نفي الضرر . 7 - تحرير الوسيلة في مجلدين . 8 - توضيح المسائل . 9 - تعليقة على العروة الوثقى . 10 - تعليقة على وسيلة النجاة . 11 - تقريرات درس الأصول للسيد البروجردي . 12 - تعليقة على كفاية الأصول . 13 - تعليقة على فصوص الحكم . 14 - تعليقة على مفتاح الغيب . 15 - تعليقة على شرح حديث شرح الجالوت للقاضي سعيد . 16 - تهذيب الأصول . 17 - تفسير سورة الحمد . 18 - جهاد النفس والجهاد الأكبر .

--> ( 1 ) الطهراني : الذريعة 18 / 13 ، 21 / 123 ، 22 / 152 ، الرازي : آثار الحجة 1 / 45 ، السراج : الإمام الحكيم ص 38 ، محمد أمين نجف : علماء في رضوان اللّه ص 375 - ص 376 ، النداء الأخير ص ( ه - ي ) .