وأصبح عالما فاضلا محققا ، منصبا في كل أوقاته على الاشتغال ، حسن التحرير ، تقي التصنيف ، وقد كتب ما أملاه أستاذه الإمام السيد محمد حسن الشيرازي في مجالس دروسه في الفقه ، وقد ألف ما يلي : 1 - أصول الفقه . 2 - التقريرات الأصولية . 3 - كتاب البيع ، استدلالي . 4 - مجلد في العبادات . توفى السيد إبراهيم الدامغاني عام 1291 ه / 1874 م . السيد جعفر بن السيد محمد مهدي الخوانساري تتلمذ السيد جعفر بن السيد محمد مهدي بن السيد الحسن الخوانساري على أعلام مدينة النجف الأشرف منهم « 1 » : 1 - الشيخ محمد حسن النجفي ( صاحب الجواهر ) . 2 - الشيخ مرتضى الأنصاري . 3 - الشيخ محسن خنفر . وأصبح عالما فاضلا فقيها ، ويقول الشيخ الطهراني : رأيت بخطه فهرس أسماء العلماء المذكورين في كتاب لؤلؤة البحرين « 2 » ، وألف السيد جعفر الخوانساري في الفقه والرجال ما يلي « 3 » : 1 - أعمال شهر رمضان . 2 - رسالة في أبي بصير . 3 - كتاب المكاسب وعليه إجازة الشيخ محمد قاسم النجفي .

--> ( 1 ) الطهراني : طبقات أعلام الشيعة / الكرام البررة 2 / 67 ، الأمين : أعيان الشيعة 7 / 102 . ( 2 ) الطهراني : مصفى المقال ص 108 . ( 3 ) الطهراني : طبقات أعلام الشيعة / الكرام البررة 2 / 67 ، الأميني : معجم رجال الفكر ص 173 .