توفى الشيخ باقر مروة في مدينة النجف عام 1303 ه / 1886 م وقيل في مدينة الكاظمية وهناك من يحدد وفاته بين 1290 ه - 1295 ه ، وقد رثاه السيد محسن الأمين العاملي بقصيدة منها « 1 » : هو الدهر بادي الغدر جم دواهيه * فأي وفاء للزمان ترجيه وحسب الفتى في دهره الموت واعظا * وأي امرئ سهم المنية يخطيه وهل يسلم المطلوب والموت طالب * تخب به أيامه ولياليه

--> ( 1 ) الأمين : أعيان الشيعة 17 / 502 - 503 .