في عام 929 ه / 1523 م [ مكتبة السليمانية ، أسعد أفندي ، رقم 3877 ] . خلطت بعض المصادر التي تعود إلى الفترات الأخيرة بين حكيم شاه وبين محمد بن مبارك شاه ( ت 740 ه / 1339 م ) المعروف ب « ميريك » البخاري ، فنسبت بعض المؤلفات التي تعود إلى ميريك البخاري إلى حكيم شاه [ مثلا انظر : هدية العارفين ، 2 / 229 ؛ كحالة ، 11 / 170 ؛ الزركلي ، 7 / 17 - 18 ] . آثاره 1 - تفسير القرآن ( تفسير حكيم شاه ) ، اعتبر أهم مؤلفات الكاتب ، وتذكر معظم المصادر أنه تفسير يبدأ من سورة الفتح حتى نهاية القرآن الكريم ، غير أن إسماعيل باشا البغدادي يبين أن هذا التفسير يبدأ من سورة النحل [ هدية العارفين ، 2 / 229 ] ؛ 2 - كتاب الربط بين السور والآيات ( ربط السور والآيات ) ، توجد منه نسخة بخط المؤلف في مكتبة السليمانية [ آيا صوفيا ، رقم 375 ] . ويذكر أنه كتب في مكة المكرمة من أجل تقديمه هدية إلى بايزيد الثاني . وقام أيوب صبري فاني بإعداد رسالة ماجستير معتمدا على هذه النسخة محققا إياها ( انظر الببلوغرافيا ) ؛ 3 - حاشية على شرح العقائد النسوية ، ألف هذا الكتاب حسب ما هو مبيّن في النسخة المكتوبة بخط المؤلف والموجودة في مكتبة السليمانية [ آيا صوفيا ، رقم 2212 ] في عام 920 ه / 1514 م ، وقدم إلى السلطان سليم الأول . وتوجد من المؤلف نسختان أخريان في المكتبة نفسها [ حاجي محمود أفندي ، رقم 1419 ؛ جار الله أفندي ، رقم 1162 ] ؛ 4 - حاشية على شرح العقائد العضدية للدواني ، يبدو في هذا الكتاب وقوف حكيم شاه إلى جانب الباقلاني وإمام الحرمين الجويني ضد الدواني في بعض المواضيع . وتوجد من هذه الحاشية نسخة في مكتبة حاجي سليم أغا [ رقم 605 ] ، كما توجد نسخة أخرى في مكتبة كوبرولي [ رقم 224 ] ؛ 5 - نصيحت‌نامه ، مؤلف كتب باللغة الفارسية من أجل تقديمه إلى السلطان سليمان القانوني . وفيه دعّم وصاياه التي تتناول الحفاظ على الصحة بالآيات والأحاديث . وتوجد منه نسخة في مكتبة السليمانية [ الشهيد علي باشا ، رقم 2799 / 3 ] ؛ 6 - الرسالة في الأسباب الستة الضرورية ، رسالة كتبها من أجل أن يقدمها إلى السلطان سليمان القانوني أيضا . وتحتوي على وصاياه المتعلقة بالصحة . وتوجد من هذه الرسالة نسخة في مكتبة نور عثمانية [ رقم 3509 ] ؛ 7 - شرح المجاز في الطب ، عبارة عن شرح لمؤلف « المجاز » ( مجاز القانون ) لابن النفيس . و « المجاز » في الوقت نفسه هو مختصر لمؤلف « القانون في الطب » لابن سيناء وذلك باستثناء الأقسام الثلاثة الأولى التي تحتوي على قسم علم التشريح . ويتضمن الكتاب الأمراض وطرق علاجها . وتوجد منه نسخة في مكتبة السليمانية [ بشير أغا ، رقم 509 ؛ داماد إبراهيم باشا ، رقم 123 ] ، كما توجد نسخة في مكتبة جامعة استانبول [ المخطوطات العربية ، رقم 2326 ] ؛ 8 - ترجمة مجالس النفائس ، عبارة عن ترجمة باللغة الفارسية لمؤلف « مجالس النفائس » الذي كتبه علي شيرنوايي بتركية جغاطاي لتراجم الشعراء . وأثناء عملية الترجمة لم يقم القزويني بترجمة مقدمة علي شيرنوايي وكتب مقدمة جديدة