لقد وضعت المنظمة نصب عينها أن تتحقق من خلال إصدار هذه الموسوعة الأهداف التالية : * تعريف العالم بحضارة العرب وإسهاماتهم الفكرية في مسيرة الحياة البشرية وبآثار علمائهم في مجالات العلوم المختلفة . * إحياء ذكرى العلماء والمبدعين والمفكرين الذين كتبوا في مختلف ضروب المعرفة ، والتمثل الجاد لمكانة الحضارة العربية الإسلامية في تاريخ العلم في العالمين الإسلامي والغربي . * التصدي للمحاولات التي قامت بها دور النشر الأجنبية لإصدار طبعات لموسوعاتها باللغة العربية بما تضمنت من تحريف متعمد يسيء للعرب وحضارتهم . * تكوين وعي جديد لدى المثقف العربي يجعله يثق في التراث العربي ودوره في تنمية المعرفة ورقيّ الإنسانية . * إدامة الاتصال المتجدد والدائم بين الأجيال العربية عن طريق الموسوعة التي سوف تتعهد بالتحديث والتطوير جيلا بعد آخر ، حيث يساهم كلّ جيل من العلماء في المراجعة المستمرة لمادتها العلمية . * توفير مصدر علمي عربي موثوق به ، يكون مرجعا أمينا لكلّ طلاب المعرفة من الأساتذة والباحثين والطلبة . * إتاحة الفرصة للعلماء والباحثين العرب لكتابة تاريخهم الثقافي والحضاري من وجهة نظرهم ، وتصويب الأخطاء التي تسربت إلى هذا التاريخ من غيرهم ، سواء كانت متعمدة أو عن جهل . * اللحاق بالأمم والدول والشعوب التي استكملت إصدار موسوعات عن حضارتها ، سواء منها الدول المتقدمة ، أو دول الجوار ، أو دول العالم الثالث . وإذ يخالجنا اليقين أن بعض هذه الأهداف أو كلّها قد يتحقق عندما تستكمل هذه الموسوعة كلها وفق الخطة المرسومة لإصدارها ، فإن ما يجعلنا أكثر تفاؤلا ، ويرفدنا بالعزيمة والإصرار والثقة بالنفس ، التفاف النخب العلمية التي تعاونت معنا