خيابان تعمير كرد و املاك و دكاكين بر سكنهء آن وقف ساخت و خود در آنجا تدريس مىنمود و از آن تاريخ آن مدرسه بمدرسهء ملا باقر معروف گرديد . بسال 1090 ق باصفهان درگذشت و جنازه‌اش را بمشهد حمل كرده در مدرسهء ميرزا جعفر در سرداب محاذى قبر شيخ حر عاملى دفن نمودند . ( فوائد الرضوية ص 425 ) 1 - تعليقة الآقا حسين الخوانسارى على الحاشية التى علقها المحقق السبزوارى على رسالة شبهة استلزام ( عربى ) : طهران ، 1317 ق ، سنگى ، وزيرى ، 314 ص ، با رسالهء تعادل و تراجيح سيد محمد كاظم طباطبائى . 2 - ذخيرة المعاد فى شرح الارشاد ( عربى ) : علامهء حلى ، شرح تا آخر كتاب حج ، طهران ،