مقبره‌اش در مجاورت چهارسوق نقاشى در محلهء جيران واقع ، و در زمان رياست هيئت علميه مسجد شاهيان در اصفهان از بين رفت . ببين كه دست رياست چو ز آستين به درآيد * نه قبر بر سر جا مىنهد نه صاحب قبرش و در ضمن محلات اصفهان مىنويسد : محله شيخ سبنا يا شيخ يوسف بنا اين محله در خواجو واقع ، و در قديم آن را دوشاباد يا روشاباد مىناميده‌اند و مقبره شيخ يوسف بنا در اين محله بوده است . آقاى مهدوى دام عزّه در دانشمندان و بزرگان اصفهان مىنويسد : قبرستان شيخ يوسف بنا كه عارف معروفى است در محله قصر منشى ( منشى الممالك ) واقع ، و اين گورستان به امر شاه‌عباس تسطيح ، و در آن مسجد و مدرسه و حمام و بازارچه و خانه و قصر بنيان شده است و بدين‌ترتيب از صورت گورستان بيرون آمده است و اين مقبره را در گذشته دوشاباد يا روشاباد مىگفتند . تا بدينجا به يارى خداى متعال شرح حال مرحوم صاحب رياض را نوشتيم و تاريخ اتمام آن روز پنج‌شنبه 23 جمادى الاولى سال 1405 هجرى مطابق با 25 بهمن ماه 1363 شمسى مىباشد و انا الحقير محمّد باقر ساعدى . در خاتمه اين شرح حال ، به منظور حديث نعمت به نام‌بردارى از مشايخ بزرگوارم كه در آغاز ترجمهء سفينة البحار متذكر شده‌ام مىپردازم و پس از آن به نام‌بردارى آثارى كه از اين فقير به طبع رسيده است اشاره مىكنم و له الحمد و المنه . مشايخ اجازه : 1 - والدم حجة الاسلام شيخ حسين مقدس دام ظله العالى 2 - علامه حاج شيخ محمّد رضا كلباسى متوفى 1383 هجرى 3 - علامه ميرزا محمّد على اوردبادى متوفى 1380 هجرى 4 - علامه شيخ آقا بزرگ