آن‌ها به جهاتى كه در حال حاضر جاى بيان آن‌ها نمىباشد مفقود شده و بيشتر آن‌ها را ميرزا عيسى مورد مطالعه و تصحيح قرار داده و تعليقات و افاداتى بر آن‌ها نگاشته بود . ميرزا خطش در نهايت خوبى بوده و از نوشتن اقسام خطوط به خوبى برمىآمد و در هنگام نگارش سرعت قلم داشت و علاوه بر آثار ديگران كه به استنساخ آن‌ها اقبال تامى داشت آثارى هم از خود به يادگار گذارده است كه پاره‌اى از آن‌ها تدوين شده و بخشى از آن‌ها از سواد به بياض نيامده است . آثار تدوين‌شدهء او بدين قرار است : شرح دروس شهيد اوّل در فقه كه ناتمام مانده است . رساله‌اى در كيفيت تحليف و سوگند دادن ذمىها و ديگر كفار . رساله‌اى در رؤيت هلال پيش از زوال خورشيد . رساله‌اى در مسأله نماز جمعه . تعليقاتى بر تفسير كلام اللّه مجيد و كتب اربعه حديث و ديگر كتاب‌هاى فقهى و اصولى و عربى . ميرزا در محلهء شيخ يوسف بنا مىزيسته است . صاحب رياض مىنويسد : محله شيخ يوسف از محلات بيرون از شهر اصفهان و متصل به اصفهان است و مردم اصفهان عموما آن محله را به عنوان « شيخ حسن بنا » مىخوانند و شيخ يوسف از بزرگان مشايخ صوفيه بوده و به كار بنايى اشتغال مىورزيده است و فرزندانش نيز به شغل پدر ادامه مىدادند . شيخ يوسف نيز در همان محل زندگى مىكرده و هنگامى كه در گذشته وى را در آن محل دفن كردند و بقعه و مزارش هم‌اكنون معروف است و آن محل را به نام وى ناميدند . آقاى مهرآبادى در آثار ملى اصفهان در ضمن افراد سرشناس محله جيران اصفهان مىنويسد : شيخ يوسف بنا از بزرگان عرفاى اصفهان بوده است و