سنة ثمان وثلاثين ومائة ، قبل وفاة أبيه بعشرين سنة . ولإسماعيل بن جعفر الصادق طائفة من الشيعة يقولون بإمامته ، وهم موجودون الآن . وعقب إسماعيل بن جعفر الصادق من رجلين : محمّد ، وعلي . فأمّا محمّد ، فهو امام الميمونيّة ، وقبره ببغداد . وكان مع عمّه موسى الكاظم ، يكتب له السرّ إلى الشيعة في الآفاق ، فلمّا ورد الرشيد إلى الحجاز سعى محمّد بن إسماعيل بعمّه الرشيد ، فقال : ما علمت أنّ في الأرض خليفتين يجبى اليهما الخراج ، فقال الرشيد : ويلك أنا ومن ؟ قال : موسى بن جعفر ، فأظهر اسراره ، فقبض الرشيد على موسى الكاظم وحبسه ، وكان سبب هلاكه . وحظي محمّد بن إسماعيل عند الرشيد ، وخرج معه إلى العراق ، ومات ببغداد . ودعا عليه موسى الكاظم بدعاء استجابه اللّه تعالى فيه وفي أولاده . ولمّا ليم موسى في صلته والاحسان اليه مع سعيه به ، قال : حدّثني أبي ، عن جدّي ، عن جدّه ، عن أبيه ، عن النبيّ صلّى اللّه تعالى عليه وسلّم أنّه قال : انّ الرحم إذا قطعت فوصلت ، ثمّ قطعت فوصلت ، ثمّ قطعت فوصلت ثمّ قطعت ، قطعها اللّه ، وانّما أردت أن يقطع اللّه رحمه من رحمي . وعقب محمّد بن إسماعيل بن جعفر الصادق من رجلين : إسماعيل الثاني ، وجعفر الشاعر . فأمّا إسماعيل الثاني ، فعقبه من رجلين : أحمد ، ومحمّد .