چنان‌كه نواب اربعهء امام زمان عليه السّلام در اين شهر سكونت داشته ومرجعيت علمي وعملي شيعه در اين خطّه استقرار داشت . ورود شيخ طوسي به بغداد وزعامت شيخ مفيد شيخ طوسي در سال 408 ه ق در حالىكه 23 سال از عمر بابركتش مىگذشت ، به بغداد آمده ودر درس رئيس شيعه شيخ مفيد رحمه اللّه شركت كرد . شيخ مفيد علاوة بر مرجعيت جهان تشيع ، شاگردان بسيار ارزنده‌اى را تربيت مىكرد كه همگى در شمار أعاظم علماى شيعه به شمار مىروند ، معروف‌ترين آن‌ها علم الهدى سيّد مرتضى ، وبرادر نابغه‌اش سيّد رضى ، أحمد بن علي بن عباس نجاشي ، سعد بن عبد العزيز ، أبو الفتح كراجكى هستند وهنگام ورود شيخ طوسي به بغداد به جز سيّد رضى كه در سال 406 ه ق از دار دنيا رفته بود همگى در قيد حيات بوده ودر درس شيخ مفيد شركت مىكردند . دانشمند جوان خطّه طوس ، مدت پنج سال ؛ يعنى تا پايان عمر شيخ مفيد قدّس سرّه مداوم از محضر پرفيض ايشان بهره‌مند بود . شيخ طوسي در زمان حيات أستاذ بزرگوارش شيخ مفيد اقدام به نوشتن شرح كتاب « المقنعة » ايشان با نام « تهذيب الأحكام » نمود كه بهترين دليل براي شناسايى مقام علمي ونبوغ كم‌نظير وى است وطي ده قرن گذشته تاكنون مأخذ ومدرك پرارزش حديث وفقه شيعه بوده وهست ونيز يكى از چهار كتاب اصلى شيعه به شمار مىآيد ، البتة اين كتاب در دوران حيات شيخ مفيد به پايان نرسيد وپس از اتمام كتاب طهارت بود كه شيخ مفيد به ملكوت أعلى پيوست . رحلت شيخ مفيد وزعامت سيّد مرتضى نابغة بىنظير شيعه وجهان بزرگ عالم تشيع ، شيخ مفيد در سال 413 ه ق به عالم ملكوت رحلت فرمود .