وقد رثاه جمع من العلماء والشعراء في أبيات : منهم : العلّامة الشيخ محمد السماويّ صاحب الطليعة من شعراء الشيعة قال في رثائه ومادة تاريخ وفاته : وشيخنا الباقر الاصفهاني * ابن التقى العالم الرباني مضى به قبر بقرب الجسم * ارّخ « مضى بباقر وعلم » « 1 » ( 1301 ) ومنهم : الحاج الميرزا علي المستوفي الأنصاري ( 1248 - 1305 ) والد الميرزا حسن الجابري الأنصاري صاحب تاريخ أصفهان يقول في بيتين فيه مادة تاريخ وفاته بالفارسية : أصل أو چون ز نجف بود سوى أصل برفت * اين جهان داد وجنان يافت بپاداش عمل سال تاريخش از انصارى جستم گفتا * « موطن شيخ نجف بود به انجام وأزل » « 2 » ( 1301 ) ومنهم : الأديب الأريب والشاعر الأستاذ فضل اللّه خان الاعتمادي الخوئي المتخلص ببرنا المولود عام 1309 ش - حفظه اللّه تعالى - يقول إجابة لدعوتنا في أبيات بالفارسية فيها مادة تاريخ وفاته : شيخ مفتى ، محمد باقر * فحل نامى ومقتداى صفى

--> ( 1 ) عنوان الشرف في وشي النجف / 92 ونقل عنه العلّامة الروضاتي في مقدمة نفحات الروضات / 119 . ( 2 ) تاريخ أصفهان ورى / 290 .