ودفن في الصحن الحيدري الشريف في مقبرة أستاذه الشيخ محمد حسين النائيني بالحجرة السادسة على يسار الداخل إلى الصحن الحيدري من الباب الكبير ( باب الساعة ) . وقد أرخ وفاته المرحوم السيد محمد الحلي قال : فجع الغري وأصبحت * تبكي القداسة والعلوم لما قضى شيخ الفضائل * من به العليا تريم إن ( الحسين ) لآية * فيها الشريعة تستقيم الحلة الفيحاء صارت * فيه تحسدها النجوم وبه الغري سما مقاما * حين راح به يقيم ساد الظلام بفقده * فوفاته خطب جسيم فجع الوصي فأرخوا * ( رزء الحسين به عظيم ) « 1 » 1394 ه رحمك اللّه يا سيدي ، وحباك من رضاه وغفرانه في آخرتك ما آنس وحشتك ، ووفقنا لنحفظ حقك علينا ما دمنا نشعر بالحياة ، ونستضيء بالنور .

--> ( 1 ) الحسيني - المصدر السابق : 39 .