مصنفات مصنفات آن مرحوم بسيار است مثل شرح بر اصول كافى و مفاتيح الغيب كه مقدمهء تفسير بر قرآن نگاشته است و تفسير قرآن كه مهمات آيات قرآنيه را تفسير و تحقيق فرموده و اسفار اربعه در فن حكمت اعلى در چهار سفر و شواهد ربوبيه كه بسيار كتاب مطبوع و مشكلى است و مبدء و معاد و شرح بر هدايه اثيريه و رسالهء حدوث و كتاب مظاهر و كتاب مشاعر و حكمة عرشيه و كتاب اسرار الايات و رساله در حشر جميع اشياء و رساله در تشخص و رساله در اتصاف مهيت بوجود و رسالهء موسومه بسر النقطه و رساله در خلق الاعمال و رساله در تصور و تصديق و رسالهء اجوبهء نصيريه و رسالهء كسر الاصنام و رساله در اجوبهء مسائل معاصر خود شمس الدين گيلانى و حواشى و تعليقات بر الهيات شفا و تعليقات بر منطق و حكمت كتاب حكمة الاشراق سهروردى و شايد هم بعضى از نوشته‌هاى ديگر داشته كه از بين رفته است . تلاميذ و شاگردان او مرحوم اللّه وردى خان كه از رجال بزرگ دورهء صفويه است مدرسه در شيراز بنا نموده كه هنوز هم بنام مدرسهء خان باقى است ، صدر المتألهين صاحب ترجمه را راضى نمود كه در مدرسهء وى تدريس نمايد . چندين سال كه آن مرحوم مشغول بافاضت بوده شاگردان بسيارى تربيت نموده است كه عده‌اى از آنان براى حقير معلوم است : يكى مرحوم محمد بن مرتضى الملقب بمحسن المتخلص بالفيض الكاشانى كه سمت اختصاصى به مرحوم صدر الدين داشته و داماد وى بوده است دوم مرحوم مولى عبد الرزاق ابن الحسين اللاهيجى كه متخلص بفياض است و او نيز داماد استاد بود و بسيار محقق بوده و در تدبير معاشرت و زندگى زبردست و هشيار بوده ، مشرب او در حكمت ظاهرا مخالف طريقه استاد است و به نظر چنين مىنمايد كه به مشرب مشّائين نزديك است ولى از آخر جلد دوم شوارق او مستفاد مىشود كه اين خود تدبير عملى بوده است . سوم مرحوم شيخ